Generar y transferir conocimientos científicos de los ecosistemas y recursos naturales de la región de Magallanes y Antártica Chilena, para su conservación y desarrollo sustentable.
Conectar la región de Magallanes y Antártica Chilena a través de la actividad científica.
Visión del CEQUA
Ser un centro sustentable y de referencia en ciencia, innovación y tecnología en Magallanes y el resto del país, realizando CIENCIA LOCAL DE IMPACTO GLOBAL.
Misión del CEQUA
Realizar investigación científica que impacte en forma positiva el desarrollo transversal y multisectorial de la región de Magallanes y Antártica Chilena a través de la generación, difusión y transferencia tecnológica del conocimiento creado por el centro.